生物質發電是利用秸稈等生物質所具有的生物質能進行的發電，是可再生能源發電的一種，也是處理農林廢棄物的有效途徑。然而，在國家支持生物質發電產業發展的背景下，一些生物質發電企業的贏利水平卻不甚理想，主要原因是生物質發電行業技術水平參差不齊，管理水平有高有低，各地項目資源量和供應模式情況差異很大，因此贏利水平差別較大。

秸稈等燃料資源收集難成為首要因素，國家推廣的秸稈還田和秸稈氣化等其他秸稈利用方式可能造成地方政府對秸稈利用政策無法保持持續，同生物質發電競爭燃料資源，加劇了秸稈收集難的問題。秸稈收集困難主要受制于運輸和人力成本，秸稈體積大、質量輕，運輸車輛超高超寬普遍存在，常被交警處罰，如果運輸半徑超過50公里，運輸成本就會太高。另外，秸稈經紀人的數量還很少，如果農民雇工收秸稈，銷售秸稈的收入遠不抵人力成本，還不如一燒了之。

由于生物質電廠由省級主管部門審批，各地生物質電廠在短期內一哄而上，在區域燃料資源一定的情況下，企業布點增多，造成原料資源的惡性競爭，原料價格不斷攀升。相對于同等規模火力發電，生物質發電投資成本要高出一倍以上，而且人力等運營維護成本也高于火力發電。在燃料價格、維保成本等綜合費用持續上漲的情況下，0.75元/千瓦時的上網電價顯得過低，使得生物質發電企業掙扎在盈虧平衡線上。對于一些附帶供熱的生物質電廠，供熱收入提升了電廠的盈利水平，較之那些將售電做為唯一收入的電廠，其盈利能力相對要改善許多。

特別的，生物質發電行業中的垃圾發電是唯一擁有成熟商業模式的行業，由于擁有包括垃圾處理費、上網電價收入和碳減排收入三部分穩定的收入來源，因此其盈利能力要好于其他類型的生物質發電企業，也成為了行業內的投資熱點。

基于資產的角度，目前垃圾焚燒發電市場的商業模式可以分為“輕資產”和“重資產”兩種模式。“輕資產”模式以EPC、設計、咨詢、運營等不參與投資的環境服務為主；“重資產”則更多地以投資帶動其業績增長，典型地商業模式有BOT/TOT、BOO、BT、收購兼并等。

自1988年我國第一座垃圾焚燒發電廠投產以來，經過不斷的摸索，在經歷了政府直接投資、政府特許大型國有企業經營和政府特許經營權市場招標三種商業模式階段之后，垃圾焚燒發電最終形成了以政府特許經營權市場化招標-建設-運營-轉讓(BOT)為主流的商業模式，目前我國已投產的和在建的垃圾發電廠大部分都是這種模式。

垃圾發電項目具有前期投資大、運營成本相對較低的特點，采用BOT模式，政府可以用將來按政策征收的垃圾處理補貼費來發揮現實的環境效益，變以前的一次集中支付為分期支付，可以進一步減輕財政壓力，有效地加快基礎設施建設步伐，滿足社會對公共工程和基礎設施的需求。BOT模式可以從國際、國內乃至民間多渠道融資，對于國內民間資本和國外投資者，BOT模式可以在越來越激烈的市場競爭中提供一個長期的、具有穩定可靠投資回報的投資方式。